Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa7P02830 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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