Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01787 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01787 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01787 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms