Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01748 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01748 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01748 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01748 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01748 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01748 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01748 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01748 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01748 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01748 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01748 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01748 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01748 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms