Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms