Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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