Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copb2O55029 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Copb2O55029 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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