Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zmat3O54836 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms