Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sp100O35892 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sp100O35892 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sp100O35892 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sp100O35892 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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