Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms