Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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