Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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