Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ColqO35348 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ColqO35348 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ColqO35348 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ColqO35348 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms