Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms