Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms