Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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H2-Q1O19441 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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