Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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