Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MttpO08601 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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MttpO08601 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MttpO08601 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MttpO08601 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MttpO08601 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MttpO08601 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MttpO08601 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MttpO08601 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MttpO08601 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MttpO08601 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms