Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms