Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r88L7N1W8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r88L7N1W8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms