Protein–RNA interactions for Protein: K7N693

Gm3043, Predicted gene 10408, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3043K7N693 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3043K7N693 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3043K7N693 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3043K7N693 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3043K7N693 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3043K7N693 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms