Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms