Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm5849J3QPE5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm5849J3QPE5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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