Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms