Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms