Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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