Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3tc1G3X9F6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms