Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XntrpcF8VQM8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms