Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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