Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms