Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm28048F7BCN0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm28048F7BCN0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm28048F7BCN0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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