Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms