Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29094F6Q785 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms