Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm1E9Q9Q2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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R3hdm1E9Q9Q2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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R3hdm1E9Q9Q2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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R3hdm1E9Q9Q2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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R3hdm1E9Q9Q2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
R3hdm1E9Q9Q2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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