Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms