Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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