Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm9972E9Q053 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9972E9Q053 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms