Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms