Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20425E9Q035 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms