Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms