Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms