Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms