Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6685D3YYP3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms