Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm17333C6EQI3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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