Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms