Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cspp1B2RX88 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms