Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms