Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt4B2RU40 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms