Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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