Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms