Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nfx1B1AY10 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nfx1B1AY10 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nfx1B1AY10 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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